Ordliste
Korte, presise forklaringer av begrepene du møter i avl, genetikk og fiskehelse.
A
- Arvbarhet(heritabilitet, h², heritability)
- Andelen av variasjonen i en egenskap mellom individer i en populasjon som skyldes additive genetiske forskjeller, oppgitt som et tall mellom 0 og 1.
- Avl(breeding)
- Planmessig bruk av arvelig variasjon for å forbedre en populasjon over generasjoner, ved at bare utvalgte individer får føre arven videre.
- Avlsmål(breeding goal)
- Listen over egenskaper et avlsprogram skal forbedre, med vekter som sier hvor viktig hver egenskap er.
- Avlsverdi(EBV, estimated breeding value, genetisk verdi)
- Et estimat av hva et individ gir videre til avkommet for en egenskap, beregnet ut fra egne målinger og målinger på slektninger.
E
- Effektiv populasjonsstørrelse(Ne, effective population size)
- Størrelsen på en ideell populasjon som ville hatt samme innavlsøkning som den faktiske. Den er vanligvis mye mindre enn antall dyr.
F
- Familiebasert avl(familieseleksjon, family selection)
- Avl der fisk fra kjente familier registreres og testes, slik at kandidatene kan rangeres ut fra resultatene til søsken og andre slektninger.
- Fenotype(phenotype)
- Det man kan observere eller måle hos et individ, for eksempel vekt, lusetall eller om det overlevde en smittetest. Fenotypen er summen av gener og miljø.
G
- Generasjonsintervall(generation interval)
- Gjennomsnittlig alder på foreldrene når avkommet blir født. Det avgjør hvor mange avlsrunder man får per år.
- Genetisk framgang(seleksjonsrespons, response to selection, avlsframgang)
- Hvor mye gjennomsnittet i en egenskap flytter seg fra en generasjon til neste som følge av seleksjon. Regnes ut som R = i × h² × σ.
- Genomisk seleksjon(genomic selection, GS)
- Seleksjon der avlsverdien beregnes fra DNA-markører i hele genomet, slik at man kan rangere også individer som ikke selv er testet.
- Genotype(genotype)
- Den genetiske sammensetningen hos et individ, altså hvilke varianter av genene det har arvet fra foreldrene.
- Genredigering(CRISPR, gene editing)
- Metoder som endrer DNA på bestemte steder i genomet, for eksempel CRISPR/Cas9. Dette er noe annet enn selektiv avl.
- GWAS(helgenomisk assosiasjonsstudie, genome-wide association study)
- En studie som tester om tusenvis av variasjonspunkter i genomet, ofte SNP-er, har sammenheng med en egenskap hos mange individer.
H
- Helsøsken(fullsøsken, full-sibs)
- Søsken som har både mor og far felles. Helsøskengrupper er sentrale i familiebasert avl fordi de deler halvparten av genene sine i gjennomsnitt.
I
- Innavl(inbreeding)
- Paring mellom slektninger, som øker sjansen for at et avkom arver like genvarianter fra begge foreldrene. Det kan gi dårligere helse og lavere avlsframgang.
- Introgresjon(introgression, genetisk innkrysning)
- At gener fra en populasjon, for eksempel oppdrettslaks, blir innlemmet i en annen, for eksempel en villaksbestand, gjennom gjentatt kryssing.
- IPN (infeksiøs pankreasnekrose)(infectious pancreatic necrosis, IPN)
- En virussykdom hos laksefisk som særlig rammer yngel og ungfisk.
K
- Kjønnsmodning(sexual maturation, tidlig modning)
- Når fisken blir kjønnsmoden. Tidlig kjønnsmodning er ofte uønsket i oppdrett fordi den påvirker vekst og kvalitet.
L
- Lakselus(Lepeophtheirus salmonis, sea lice)
- En parasittisk krepsdyr (Lepeophtheirus salmonis) som lever på laksefisk i sjøen og et av de største fiskehelseproblemene i oppdrett.
M
- Markørassistert seleksjon(MAS, marker-assisted selection)
- Seleksjon der man velger direkte på en kjent genvariant eller markør som har stor effekt på en egenskap.
P
- Pankreassykdom (PD)(pancreas disease, PD)
- En virussykdom hos laksefisk forårsaket av salmonid alphavirus (SAV).
Q
- QTL(quantitative trait locus, kvantitativ egenskapslokus)
- Et område i genomet som har sammenheng med variasjon i en egenskap som styres av flere gener. QTL kan ha liten eller stor effekt.
R
S
- Seleksjon(selection)
- At noen individer får flere avkom enn andre fordi de har bestemte egenskaper. I avl er seleksjonen styrt av mennesker og rettet mot et avlsmål.
- Seleksjonsintensitet(selection intensity, i)
- Et mål på hvor sterkt man velger: hvor mange standardavvik bedre enn gjennomsnittet de utvalgte foreldrene i snitt er.
- Selektiv avl(seleksjonsavl, selective breeding)
- Avl der man velger ut individer med ønskede egenskaper som foreldre, slik at disse egenskapene blir vanligere i neste generasjon.
- Smolt(laksesmolt)
- Ungfisk av laks som er blitt klar til å leve i saltvann etter å ha tilbrakt første del av livet i ferskvann.
- SNP(single nucleotide polymorphism, enkeltnukleotidpolymorfi)
- Et punkt i DNA der individer i en populasjon kan ha ulik bokstav. SNP-er brukes som genetiske markører i avl.
- Stamfisk(broodstock, foreldrefisk)
- Fisk som er valgt ut til å bli foreldre til neste generasjon i et avlsprogram.
- Stamtavle(pedigree, slektstavle)
- Registrering av hvem som er foreldre til hvem. I avl brukes stamtavlen til å beregne slektskap og avlsverdier.
- Standardavvik(σ, standard deviation)
- Et mål på hvor mye verdiene i en egenskap typisk spriker rundt gjennomsnittet. Avlsframgang oppgis ofte i standardavvik.
U
- Utfordringstest(smittetest, challenge test)
- Et kontrollert forsøk der fisk bevisst utsettes for smitte, for eksempel lus eller virus, for å måle hvor motstandsdyktige de er.
V
- Variasjonskoeffisient(CV, coefficient of variation)
- Standardavviket delt på gjennomsnittet, oppgitt i prosent. Den brukes til å omregne framgang i standardavvik til prosent av gjennomsnittet.